Alt+F otevře formulář

»Chytrý« systém z TUL poslouží epidemiologům a hygienikům v čase koronaviru i při jiných epidemiologických šetřeních

EpiGIS_zpředu Jiří Šmída, Jana Prattingerová a Vladimír Valenta - kopie.JPG

EpiGIS už liberečtí hygienici zavedli. Zpředu Jiří Šmída, Jana Prattingerová a Vladimír Valenta

Informační systém EpiGIS, který vyvinuli vědci z Technické univerzity v Liberci ve spolupráci s krajskou hygienickou stanicí, mohou epidemiologové nasadit při šetření epidemie koronaviru, použitelný bude také v budoucnu pro monitorování jiných epidemií. Liberečtí epidemiologové už systém zavádějí, další krajské hygienické stanice o něj projevily zájem.

„Nový program z liberecké univerzity nám dovoluje evidovat všechny informace potřebné pro epidemiologické šetření jakékoliv epidemie. A to jsou informace o osobě, místě a času. s touto trojicí informací nám umožňuje mnohem lépe a rychleji identifikovat ohnisko nákazy, což je pro nás hygieniky zásadní,“ říká Vladimír Valenta, ředitel Krajské hygienické stanice Libereckého kraje se sídlem v Liberci (KHS v Liberci), který byl do roku 2016 hlavním hygienikem ČR a v současné době také působí na naší fakultě zdravotnických studií.

Program EpiGIS vyvíjí multioborový tým geoinformatika Jiřího Šmídy z katedry aplikované matematiky Fakulty přírodovědně-humanitní a pedagogické TUL (FP), spolupracují na něm také odborníci z naší fakulty mechatroniky, informatiky a mezioborových studií, externí programátoři z firmy Coffee Workers a epidemiologové z Krajské hygienické stanice Libereckého kraje. Program vyvíjejí od roku 2019 v projektu aplikovaného výzkumu aaaaaaaaapodpořeného grantem z programu ETA Technologické agentury ČR. Měl sloužit epidemiologům přesně pro podobná šetření a analýzy v případě epidemií, ovšem koronavirus jeho vývoj usměrnil a.

„Hned s prvními náznaky vládních opatření proti COVID-19 na začátku března nám došlo, že to, na čem jsme shodou okolností pracovali, potřebují epidemiologové pro zvládnutí práce v čase této pandemie. bbbbbbbbbbbbbbMuseli jsme jednat rychle. V řádech dnů jsme pozměnili priority a harmonogram výzkumného záměru a vše směřovali k tomu, abychom mohli epidemiologům nabídnout funkční nástroj, který je nezaměstná na při zaškolování, ale který jim okamžitě pomůže v jejich práci,“ říká vedoucí vývojového týmu Jiří Šmída s tím, že například testovací fázi bylo potřeba seškrtat do několika dnů a celý systém dále ladit za pochodu.

„Výstupní data jsou ale spolehlivá, za těmi si stojíme,“ dodává Šmída.

Výzkumný tým nyní pracuje na vytvoření standardů pro zadávání dat při epidemiologickém šetření, tak jejich vyhodnocování. Zásadním tématem je také získávání různých úrovní výstupů – pro epidemiology, hygieniky a jiné odborníky například z ministerstev až po starosty obcí, média a širokou veřejnost.

„Máme jedinečnou možnost cccccccccccccccccpřispět k pochopení závažnosti aktuální situace a jejího analýzami dat,“ říká hlavní programátor projektu EpiGIS Vratislav Žabka z ústavu mechatroniky a technické informatiky Fakulty mechatroniky, informatiky a mezioborových studií TUL.

Klíčovým stavebním kamenem nového systému jsou geografické informační systémy. Ke každé geografické analýze je tak možné vygenerovat grafy a mapové podklady.

Po měsíc a půl trvajícím zákazu vstoupili studenti znovu do univerzitních laboratoří. Dokončují praktické testy pro své závěrečné práce. Mikroskopy znovu přibližují, přístroje odečítají naměřené hodnoty.

Laboratoře katedry strojírenské technologie Fakulty strojní TUL (FS) dopoledne znovu alespoň trochu vypadají jako při běžném chodu školy. U Charpyho kladiva právě stojí student navazujícího studijního programu technologie plastů a kompozitů Jan Novák. Rázovým testem zjišťuje houževnatost jednotlivých plastů. Výsledky zapracuje do ročníkové práce.

„To, že jsem nemohl měsíc a půl do laboratoře, mě v rámci praktické výuky hodně omezilo. Výuka sice probíhala formou videopřednášek, na videu jsme měli nahrané i samotné experimenty a ukázky. Měření a praktické laboratorní úlohy ale máme v každém předmětu hned několik a ty nebylo možné dělat na dálku,“ poznamenal Jan Novák.

Aby mohli pracovat na dokončování svých bakalářských a diplomových prací, smí studenti FS vkročit do laboratoří už od minulého týdne. „Popravdě jsem si myslel, že už se v tomto semestru do laboratoře ani nepodívám. K uvolnění došlo nečekaně rychle, prakticky ze dne na den. Ale jsem za to rád,“ dodal Jan Novák.

„Výhodou informačního systému EpiGIS je analytická práce s daty u všech případů v souvislosti s COVID-19 registrovaných v Libereckém kraji od začátku vypuknutí epidemie. A to jak těch testovaných s pozitivním, ale i negativním výsledkem, tak také těch ostatních, u kterých byla po návratu z ciziny nařízena povinná domácí karanténa,“ říká Jana Prattingerová, ředitelka odboru protiepidemického KHS v Liberci.

Systém EpiGIS vyvinutý ve spolupráci TUL a KHS je podle epidemiologů vedle tzv. chytré karantény budoucností hygienické služby.

Radek Pirkl https://tuni.tul.cz/rubriky/veda-a-vyzkum/id:110448